MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Clostridium sp. BNL1100 chromosome

Total Repeats: 14862

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016791	AT	4	8	22	29	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016791	AT	3	6	39	44	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016791	TC	3	6	56	61	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_016791	AT	3	6	94	99	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016791	TTA	2	6	100	105	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016791	TTG	2	6	110	115	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016791	TG	3	6	122	127	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016791	GTT	2	6	143	148	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_016791	T	6	6	179	184	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016791	A	6	6	201	206	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016791	TTAT	2	8	253	260	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016791	T	6	6	278	283	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016791	ATT	2	6	284	289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016791	A	7	7	1740	1746	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016791	TTA	2	6	1766	1771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_016791	CTA	3	9	1831	1839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_016791	TTA	2	6	1840	1845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016791	A	6	6	1871	1876	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016791	ACG	2	6	2995	3000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_016791	AATA	2	8	4377	4384	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016791	TAA	2	6	4388	4393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016791	GGA	2	6	4418	4423	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016791	AT	3	6	6670	6675	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016791	A	8	8	6676	6683	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_016791	T	7	7	6698	6704	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016791	TA	3	6	6757	6762	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016791	AAAT	2	8	6800	6807	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016791	AG	3	6	6853	6858	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016791	T	7	7	8587	8593	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016791	ATATT	2	10	8607	8616	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016791	AAT	2	6	9256	9261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016791	GTA	2	6	9269	9274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016791	ATAG	2	8	10055	10062	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016791	TAT	2	6	10093	10098	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016791	A	6	6	10121	10126	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016791	GA	3	6	10168	10173	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016791	CT	3	6	10246	10251	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_016791	CTT	2	6	10376	10381	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_016791	A	6	6	10436	10441	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016791	T	8	8	10479	10486	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016791	TGCC	2	8	10510	10517	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
42	NC_016791	CTT	2	6	10535	10540	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_016791	GATTT	2	10	10582	10591	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016791	T	8	8	10589	10596	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016791	TTA	2	6	10602	10607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016791	ATA	2	6	10616	10621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016791	A	6	6	10664	10669	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_016791	AAT	2	6	10707	10712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016791	ATT	2	6	11277	11282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_016791	AT	3	6	11314	11319	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016791	TA	3	6	11329	11334	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016791	AT	3	6	11343	11348	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_016791	TAAT	2	8	11358	11365	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_016791	TAAT	2	8	11385	11392	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_016791	TAT	2	6	11404	11409	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_016791	TATTAA	2	12	11447	11458	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016791	GGAT	2	8	11463	11470	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_016791	AT	3	6	11472	11477	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_016791	ACT	2	6	12158	12163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_016791	TAT	2	6	12750	12755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_016791	T	6	6	13098	13103	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_016791	AT	3	6	13136	13141	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_016791	AAT	2	6	13416	13421	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_016791	TAG	2	6	13425	13430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_016791	TA	3	6	13455	13460	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_016791	AAATA	2	10	13492	13501	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_016791	TGT	2	6	13542	13547	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_016791	A	7	7	13592	13598	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_016791	TTA	2	6	13631	13636	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_016791	AGG	2	6	13637	13642	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_016791	T	7	7	17247	17253	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_016791	TGC	2	6	18599	18604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_016791	TTA	2	6	18615	18620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_016791	TAAA	2	8	19679	19686	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_016791	ATA	2	6	19730	19735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_016791	ACT	2	6	19744	19749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_016791	GA	3	6	19800	19805	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_016791	A	6	6	19826	19831	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_016791	ATT	2	6	19914	19919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_016791	TCT	2	6	19975	19980	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_016791	TAC	2	6	19986	19991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_016791	TAT	2	6	20054	20059	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_016791	CTG	2	6	20078	20083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_016791	TAA	2	6	20112	20117	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_016791	CAT	2	6	20120	20125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_016791	ATA	2	6	20168	20173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_016791	A	7	7	20213	20219	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_016791	A	6	6	20222	20227	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_016791	TAT	2	6	21974	21979	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_016791	A	6	6	21982	21987	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_016791	ATT	2	6	21991	21996	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_016791	AT	4	8	22000	22007	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_016791	AAT	2	6	22019	22024	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_016791	TA	3	6	22045	22050	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_016791	CA	3	6	22065	22070	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_016791	TAT	2	6	22152	22157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_016791	TAA	2	6	22163	22168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_016791	TTAT	2	8	22169	22176	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_016791	AT	3	6	22175	22180	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_016791	GAA	2	6	22204	22209	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_016791	TA	3	6	22469	22474	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_016791	A	6	6	22476	22481	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_016791	AT	3	6	22512	22517	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_016791	TAA	2	6	22548	22553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_016791	TGA	3	9	22561	22569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_016791	TTA	2	6	22861	22866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_016791	TAA	2	6	22904	22909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_016791	AACAA	2	10	22913	22922	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
109	NC_016791	T	6	6	22949	22954	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_016791	AAT	2	6	23007	23012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_016791	AT	4	8	23028	23035	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_016791	GTT	2	6	23049	23054	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_016791	TA	3	6	24689	24694	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_016791	A	7	7	24704	24710	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_016791	TTTTA	2	10	24738	24747	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_016791	TAA	2	6	24756	24761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_016791	TATT	2	8	24765	24772	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_016791	TAA	2	6	24775	24780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_016791	TTG	2	6	24807	24812	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_016791	TA	3	6	24846	24851	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_016791	TAAA	2	8	24859	24866	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_016791	T	6	6	26475	26480	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_016791	TA	3	6	26482	26487	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_016791	GAT	2	6	26499	26504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_016791	A	8	8	26520	26527	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_016791	AAT	2	6	28134	28139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_016791	AT	3	6	28138	28143	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_016791	ATT	2	6	28160	28165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_016791	TAT	2	6	28182	28187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_016791	TA	3	6	28203	28208	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_016791	TTTA	2	8	28221	28228	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_016791	A	6	6	28238	28243	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_016791	TA	3	6	28251	28256	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_016791	AGG	2	6	28263	28268	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
135	NC_016791	GCA	2	6	32049	32054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_016791	TTG	2	6	32063	32068	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_016791	GGT	2	6	34010	34015	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
138	NC_016791	AAT	2	6	34433	34438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_016791	A	7	7	37620	37626	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_016791	TTA	2	6	39774	39779	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_016791	T	6	6	39787	39792	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_016791	AGG	2	6	39882	39887	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
143	NC_016791	AT	3	6	42009	42014	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_016791	A	6	6	42019	42024	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_016791	T	7	7	42058	42064	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_016791	ATT	2	6	42119	42124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_016791	ATG	2	6	42138	42143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
148	NC_016791	A	6	6	42605	42610	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_016791	AT	3	6	42646	42651	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_016791	AAT	2	6	43228	43233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_016791	GGA	2	6	43275	43280	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
152	NC_016791	ATT	2	6	43281	43286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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